После закрытия обособленного подразделения справки по форме 2-НДФЛ сдаются по месту учета головной организации. Такие разъяснения дает ФНС в письме от 01.04.2019 №БС-4-11/5938@.
Подробности заполнения формы – в разделе «Отчетность по НДФЛ» модуля «Налоговые риски в гостиничном бизнесе».