Заверять книгу покупок и книгу продаж усиленной квалифицированной электронной подписью руководитель должен только для передачи в налоговый орган, например, в рамках проведения камеральной проверки. Хранить эти документы можно не подписанными. Такие разъяснения дает ФНС в письме от 24.01.2019 №ЕД-4-15/1044. 
Аргументы налоговиков в модуле «Налоговые риски в гостиничном бизнесе».