Работник с суммированным учетом рабочего времени, который увольняется до истечения учетного периода, имеет право на повышенную оплату сверхурочной работы, как и другие работники.

В этом случае при увольнении необходимо правильно определить количество часов сверхурочной работы. 

Часы, превышающие нормальную продолжительность рабочего времени, будут являться сверхурочными и подлежат повышенной оплате в соответствии со ст. 152 ТК РФ: за первые два часа работы не менее чем в полуторном размере, за последующие часы - не менее чем в двойном размере.

Такие разъяснения дает Минтруд России письме от 21.05.2019 №14-2/ООГ-3606.

Подробности – в разделе «Сверхурочная работа» модуля «Оплата труда в медицине».